IP屬地：山西
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生信小白一枚，我不是牛人，我只是一頭開(kāi)荒牛，希望大家能在我的學(xué)習(xí)基礎(chǔ)上更進(jìn)一步匣椰，共同提高！
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大神端礼，求：R腳本傳參批量投遞腳本得到RDS呀 十分感謝
結(jié)合Seurat批量去雙胞（DoubletFinder）2022-05-18
使用背景 我們一般拿到單細(xì)胞矩陣需要做的一個(gè)預(yù)處理步驟是去雙胞禽笑，而常用的一個(gè)R包是DoubletFinder[https://github.com/chris-mcginni...
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一只末流985生物
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公眾號(hào)：TOP生物信息<br>B站：TOP菌<br>WeChat：TOPJUN996<br><br>top2讀研喻括，學(xué)習(xí)方向：癌癥基因組邀杏、腫瘤免疫、單細(xì)胞組學(xué)
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生而孤獨(dú) 活而精彩
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低級(jí)生物信息工程師脖律。<br>僅限于學(xué)習(xí)交流用途，請(qǐng)勿打賞腕侄！<br>
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2019.8月中旬開(kāi)始系統(tǒng)自學(xué)生信，<br>自學(xué)路漫漫索性報(bào)個(gè)班分预。<br><br>生信技能樹(shù)真的很棒兢交！<br><br>這是我的一個(gè)學(xué)習(xí)筆記平臺(tái)，點(diǎn)滴記錄笼痹。
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收集一些生物信息學(xué)的分析流程的文章。感謝這些簡(jiǎn)友整理的生信分析流程晴裹！ 如果簡(jiǎn)友投稿沒(méi)有被我收入專題被济，可能是我沒(méi)看到或者收入到其他針對(duì)性更強(qiáng)的專題中了。望見(jiàn)諒息拜！ ???????????????????????? 文章的收錄是有順序的溉潭，查看的時(shí)候請(qǐng)點(diǎn)擊“最新收錄”然后進(jìn)行查看净响。 ?? 全基因組測(cè)序(WGS)分析 ?? 轉(zhuǎn)錄組分析RNA-seq的分析流程 ?? 染色質(zhì)免疫共沉淀技術(shù)ATAC-Seq少欺、ChIP-Seq分析 ?? 單細(xì)胞scRNA-seq分析 ?? 癌癥的預(yù)后標(biāo)志物查找 ?? 系統(tǒng)發(fā)育演化進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建與分析 ?? 群體遺傳學(xué)分析 ?? 全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS) ?? 基因家族的分析 ?? 甲基化測(cè)序與分析 ?? KEGG/GO功能富集分析 ?? 圖形繪制具體細(xì)節(jié)的比如熱圖、曼哈頓圖的繪制等 ?? python馋贤、perl赞别、R的包的使用過(guò)程 ?? 具體工具的使用，比如GATK的使用過(guò)程 ?? 數(shù)據(jù)庫(kù)的挖掘方法配乓，比如TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)的使用 ?? 另外就是整個(gè)文章走下來(lái)的流程 ?? ?? ??
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您好仿滔，請(qǐng)問(wèn)wgbs的話計(jì)算區(qū)域甲基化水平，有什么軟件嗎犹芹？
甲基化水平計(jì)算方法
一崎页、單個(gè)位點(diǎn)甲基化水平： 單個(gè)位點(diǎn)的甲基化水平＝支持甲基化C的reads數(shù)/總的reads數(shù) 對(duì)于參考基因組上的C位點(diǎn)，有些reads（reads上此位置處是C）支持此位點(diǎn)是...
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<br>自學(xué)生信的小白，<br>生物屆的一只單身狗!<br><br>從爬蟲(chóng)過(guò)來(lái)的蛇友屿笼！
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負(fù)基礎(chǔ)學(xué)生信驴一，歡迎互相交流
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您好 想請(qǐng)教一下 這個(gè)代碼在Linux上執(zhí)行python *.py時(shí)休雌，后面輸入輸出怎么寫(xiě)? 還是在代碼里改，才接觸肝断。謝謝您
使用DSS做差異甲基化區(qū)域（DMR分析）
DSS是一個(gè)可用于做RNA-seq差異表達(dá)分析或甲基化差異分析的R包杈曲，在做差異甲基化分析時(shí)，DSS對(duì)每個(gè)CpG進(jìn)行統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)胸懈，然后根據(jù)我們指定的閾值可以篩選出差異甲基化位點(diǎn)（d...
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表觀遺傳學(xué)忠實(shí)粉洁奈，不定時(shí)更新科普文獻(xiàn)间唉，歡迎關(guān)注一起交流～
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生信工作者呈野。
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我是穿蓬蓬裙的小公舉被冒。
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