![240](https://upload.jianshu.io/users/upload_avatars/27197479/d9895ab4-03c4-481b-b45b-45dad53fa6b3.jpeg?imageMogr2/auto-orient/strip|imageView2/1/w/240/h/240)
EndHic 想比較HiC-Pro跋选,EndHic的安裝就簡單很多谓苟,就是下載即可用 EndHiC的安裝 要用到的腳本都在文件夾下官脓,直接調用就行 怎么使用呢?不得不說一下涝焙,git...
并沒有看到與疾病如何關聯(lián)的分析過程
hdWGCNA系列推文(二):分析單細胞轉錄組數(shù)據(jù)前言 Immugent在hdWGCNA系列推文第一篇:hdWGCNA:將單細胞和空間轉錄組的WGCNA分析變成現(xiàn)實[https://mp.weixin.qq.com/s?__...
進到align目錄對質量好的測序數(shù)據(jù)進行比對 1. 一個個比對,生成BAM文件 align目錄 不用-R參數(shù)也可以執(zhí)行采蚀,但后面gatk的時候會報錯 2或者循環(huán)批量比對 增加第...
這個介于3和4之間疲牵,目的是練習幾個有用的腳本,學幾個命令搏存。 隨便找?guī)讉€文件進行練習,只是為了說明問題矢洲,這些其實是RNA-seq數(shù)據(jù)璧眠,但無所謂,只是看腳本的處理有以下幾個文件 ...
原視頻6:測序質量的控制首先建立文件夾 這部分包括fastqc和multiqc兩個軟件查看測序質量读虏,以及使用trim_galore軟件進行過濾低質量reads和去除接頭责静。 1...
WGCNA原理和分析流程[http://www.reibang.com/p/9331eb5377d1] 單細胞WGCNA分析方法+隨機森林[https://www.jian...
目的:把兩組bed files 分別pool成一個bed file,而且疊加到序列區(qū)間要merge起來塑荒。合并:cat *.bed > output.bed軟件:需要 bedt...
從今天開始熄赡,我又要經常回到簡書記錄一些數(shù)據(jù)下載齿税,處理流程了彼硫。目前需要UKBB的GWAS, 用的人很多,都是大文章拧篮,大手筆词渤。我沒有找到怎么下載的。所以打算自己跟著幫助文檔學習一...
想著好久沒更新了,但我的粉絲們還是會經常來看看我韧掩,所以紊浩,決定把最近學的東西掛出來。 搜了下中文網(wǎng)疗锐,幾乎沒有對這個方法進行介紹的坊谁,一個可能是新出的,一個可能是手里沒有大樣本滑臊,不...
Note that if Boost is installed in a non-default location then its path should be specified with BOOST_ROOT in the cmake command above:
$ cmake -DBOOST_ROOT=/path/to/boost/ ..
If all of the above steps were successful, the build directory now contains ExpansionHunter executable.