發(fā)簡信
IP屬地：貴州
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介紹
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hicPro+EndHiC(二)染色體掛載
EndHic 想比較HiC-Pro客税，EndHic的安裝就簡單很多，就是下載即可用 EndHiC的安裝 要用到的腳本都在文件夾下蹈胡，直接調(diào)用就行 怎么使用呢渊季？不得不說一下，git...
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卑微的生信人，如果我的帖子對你有幫助搅轿，麻煩點點贊哦
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并沒有看到與疾病如何關聯(lián)的分析過程
hdWGCNA系列推文（二）：分析單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)
前言 Immugent在hdWGCNA系列推文第一篇：hdWGCNA：將單細胞和空間轉(zhuǎn)錄組的WGCNA分析變成現(xiàn)實[https://mp.weixin.qq.com/s?__...
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4 比對到參考基因組輸出bam文件
進到align目錄對質(zhì)量好的測序數(shù)據(jù)進行比對 1. 一個個比對幻工，生成BAM文件 align目錄 不用-R參數(shù)也可以執(zhí)行，但后面gatk的時候會報錯 2或者循環(huán)批量比對 增加第...
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3_0_4 要理解并會用的幾個腳本
這個介于3和4之間黎茎，目的是練習幾個有用的腳本囊颅，學幾個命令。 隨便找?guī)讉€文件進行練習傅瞻，只是為了說明問題踢代，這些其實是RNA-seq數(shù)據(jù)，但無所謂嗅骄，只是看腳本的處理有以下幾個文件 ...
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3 wes測序質(zhì)量的控制原視頻6:測序質(zhì)量的控制首先建立文件夾 這部分包括fastqc和multiqc兩個軟件查看測序質(zhì)量胳挎，以及使用trim_galore軟件進行過濾低質(zhì)量reads和去除接頭。 1...
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hdWGCNA：單細胞WGCNA分析方法WGCNA原理和分析流程[http://www.reibang.com/p/9331eb5377d1] 單細胞WGCNA分析方法+隨機森林[https://www.jian...
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如何合并兩個或多個bed files
目的：把兩組bed files 分別pool成一個bed file，而且疊加到序列區(qū)間要merge起來姥卢。合并：cat *.bed > output.bed軟件：需要 bedt...
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UKBB數(shù)據(jù)下載流程（第一節(jié)）
從今天開始卷要，我又要經(jīng)常回到簡書記錄一些數(shù)據(jù)下載隔显，處理流程了却妨。目前需要UKBB的GWAS饵逐， 用的人很多括眠，都是大文章，大手筆倍权。我沒有找到怎么下載的掷豺。所以打算自己跟著幫助文檔學習一...
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phesant（PHEnome Scan Analysis Tool）想著好久沒更新了壹置，但我的粉絲們還是會經(jīng)常來看看我，所以表谊，決定把最近學的東西掛出來钞护。 搜了下中文網(wǎng)，幾乎沒有對這個方法進行介紹的爆办，一個可能是新出的难咕，一個可能是手里沒有大樣本，不...
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起個詳亮的名字 ·Note that if Boost is installed in a non-default location then its path should be specified with BOOST_ROOT in the cmake command above:
$ cmake -DBOOST_ROOT=/path/to/boost/ ..
If all of the above steps were successful, the build directory now contains ExpansionHunter executable.
