@e6b267452967 我的是移碼突變
CRISPR-Cas9基因編輯5--不可或缺的sgRNA活性預實驗前言: 大家都知道CRISPR-Cas9有脫靶效應谒麦,并且每個sgRNA的效率都不一樣的,因此在做正式實驗之前哆致,我們要驗證sgRNA的效率绕德,之后優(yōu)中選優(yōu)。還是那句話摊阀,同樣的目的...
@e6b267452967 我的是移碼突變
CRISPR-Cas9基因編輯5--不可或缺的sgRNA活性預實驗前言: 大家都知道CRISPR-Cas9有脫靶效應谒麦,并且每個sgRNA的效率都不一樣的,因此在做正式實驗之前哆致,我們要驗證sgRNA的效率绕德,之后優(yōu)中選優(yōu)。還是那句話摊阀,同樣的目的...
@47d051d67d1b 如果是我的話耻蛇,我會先查文獻踪蹬,在文獻中能有答案。同時有一個叫做depmap的網站臣咖,你可以去下載里面的數據來進行查詢跃捣。不過一般還是看文獻哦。如果從未有記錄夺蛇,從未有報道的話疚漆。你可以嘗試查查有沒有這個細胞的全基因組測序數據,下載下來自己分析刁赦,或者全外顯子測序也可以娶聘。如果都沒有,那你可以:1. 自己送WGS/WES測序甚脉;2. 自己PCR這段序列丸升,送桑格測序。其余辦法我尚未想到牺氨,希望能幫到你发钝。
細胞周期學習筆記,越想簡單波闹,卻越復雜的一次學習看文獻的時候發(fā)現很多細胞周期的內容酝豪,因此想要簡單了解一下細胞周期的內容,但是當我開始看相關內容時精堕,發(fā)現內容越來越復雜孵淘。若只是了解細胞周期的大概分布不算什么,最重要的是該了解細...
@金牛座_14dd 不好意思歹篓,這個超出了我的經驗范圍瘫证,我不是很懂呢,不好意思哦~
終于把CRISPR-Cas9基因編輯系統這篇文章看完個大概了庄撮。Genome engineering using the CRISPR-Cas9 system 這篇文章真的看了好久背捌,就算一開始秉承著不求甚解的精神都看不下去,有太多的專業(yè)背...
@VvO 其實我可能不太清楚你的操作是什么,因為我是轉入到細胞中,在細胞中完成切割吃媒,然后提取gDNA進行PCR,把PCR產物跑膠么抗,切膠回收之后再做切割活性檢測,就是T7EI酶切實驗亚铁。
不知道你的操作過程是否跟我的一樣蝇刀,如果是一樣的,DNA模板是PCR切膠回收過后的徘溢,比較純并且量也大吞琐,不太可能會出現消失的情況哦捆探。
CRISPR-Cas9基因編輯5--不可或缺的sgRNA活性預實驗前言: 大家都知道CRISPR-Cas9有脫靶效應,并且每個sgRNA的效率都不一樣的站粟,因此在做正式實驗之前黍图,我們要驗證sgRNA的效率,之后優(yōu)中選優(yōu)卒蘸。還是那句話,同樣的目的...
@e6b267452967 不好意思這是我很久之前查的翻默,圖中截圖就是我在該公司截的缸沃,但是具體哪個公司忘了,現在再搜索我也搜索不到了修械,只看到abcam有一株:Human PTEN knockout A549 cell line (ab286704) 顯示19 bp deletion趾牧。或許像你說的那樣肯污,曾經公司標注翘单,之后取消了這些信息呢。
CRISPR-Cas9基因編輯1--背景介紹及gRNA設計(上)簡介和前期文章 我對之前的所有教程進行了再次詳細的總結 前言: 每當我們接觸新事物時蹦渣,都忍不住問如下圖所示之哲學三問(當然有時候問的是哄芜,這是什么?可以吃嗎柬唯?怎么做认臊?): 由于...
@VvO 其實我在做sgRNA體外活性驗證的時候也遇到過很低的條帶,原因就是可能off-target很多锄奢,并且造成了很多種切割結果失晴,導致條帶彌散。最好還是一次多試幾個sgRNA拘央,這樣能盡量選擇合意的涂屁,以免后面白做,畢竟我們做一次不容易啊灰伟。希望能幫到你拆又。
CRISPR-Cas9基因編輯不只是剪開DNA這么簡單前言 我只是搬運工,這部分內容我參考的內容有:CRISPR Editing is All About DNA Repair MechanismsCRISPR-guideMME...
@98cb69c247f1 直接跑哦栏账,不需要過濾哦~
CRISPR-Cas9基因編輯4--確定Cas9質粒構建成功+漂亮的質粒轉染簡介和前期文章 我對之前的所有教程進行了再次詳細的總結CRISPR-Cas9基因編輯之背景介紹及gRNA設計(上)[http://www.reibang.com/p/e5c...
CellPhoneDB作為出鏡率很高的細胞互作分析工具遏乔,也是大家公認的。網上有很多教程发笔,按理說在自己單細胞系列也應該出一個教程盟萨,但是由于CellPhoneDB是基于pytho...
細胞配受體通識以及常見細胞分泌信號通路[http://www.reibang.com/p/df4721d29a91]CellChat:細胞間相互作用分析利器[https:/...
@一直在努力的科研小白 沒有特殊加什么,就是10% FBS的1640了讨,我們組養(yǎng)細胞連雙抗偶讀不加捻激,或許你還要查查有無支原體污染之類的制轰。我們THP-1狀態(tài)是比較不錯的
CRISPR/Cas9基因敲除實驗全記錄(6)正式轉染+單克隆細胞篩選前期記錄 先確定目標基因CRISPR/Cas9基因敲除實驗全記錄(1)然后對目的基因進行背景調查CRISPR/Cas9基因敲除實驗全記錄(2)磨刀不誤砍柴工設計sgRNA及引...
@一直在努力的科研小白 由于我沒養(yǎng)過這個巨噬細胞,所以不是特別了解胞谭。不過首先要確定你敲除的這個基因不會影響細胞增殖垃杖,不是一個生存必須的基因。其次只能說擴大實驗范圍丈屹,我們課題組在挑THP-1單克隆的小伙伴也表示這個細胞一個96孔板挑下來也只能挑到十個左右而已调俘,看來這個細胞本身個頭就是特別小又很脆弱的樣子呢。
CRISPR/Cas9基因敲除實驗全記錄(6)正式轉染+單克隆細胞篩選前期記錄 先確定目標基因CRISPR/Cas9基因敲除實驗全記錄(1)然后對目的基因進行背景調查CRISPR/Cas9基因敲除實驗全記錄(2)磨刀不誤砍柴工設計sgRNA及引...
@RAVEN_9dc5 有可能哦~
不想再用慢病毒了旺垒,我還有什么別的選擇嗎彩库?piggyBac transposon慢病毒可快速、高效的將目的基因整合到宿主細胞基因組先蒋,非常適合用于構建穩(wěn)轉細胞株骇钦。但慢病毒也有缺點,即使是穩(wěn)轉細胞株竞漾,可能會隨著傳代次數的增加而慢慢丟失干擾或者過表達的效率眯搭。其...
@梁蛋蛋 太辛苦了~終于可以開始啦~~~!R邓辍A巯伞!恭喜恭喜1适薄7痹!糊闽!
CRISPR-Cas9基因編輯6--挑單克隆技術哪家強前言: 挑選到滿意的sgRNA之后梳玫,就要開始正式實驗,而正式實驗中細胞轉染部分我則不會再講右犹,直接到最關鍵的部分:挑取單克隆提澎。 實驗正文 1. 實驗準備 常規(guī)試劑、儀器:轉染試...
@實驗小菜雞 如果你的敲除成功是片段變小的話念链,那300-400處沒有條帶盼忌,可能提示sgRNA活性不夠。
CRISPR-Cas9基因編輯5--不可或缺的sgRNA活性預實驗前言: 大家都知道CRISPR-Cas9有脫靶效應掂墓,并且每個sgRNA的效率都不一樣的谦纱,因此在做正式實驗之前,我們要驗證sgRNA的效率君编,之后優(yōu)中選優(yōu)跨嘉。還是那句話,同樣的目的...
@梁蛋蛋 太可憐了吃嘿,啥細胞呀祠乃,不好養(yǎng)活嗎梦重?
CRISPR-Cas9基因編輯6--挑單克隆技術哪家強前言: 挑選到滿意的sgRNA之后,就要開始正式實驗亮瓷,而正式實驗中細胞轉染部分我則不會再講琴拧,直接到最關鍵的部分:挑取單克隆。 實驗正文 1. 實驗準備 常規(guī)試劑嘱支、儀器:轉染試...
@梁蛋蛋 密度高一點試試蚓胸,T25太大了,不如就用六孔板養(yǎng)著除师,平時普通的實驗沛膳,六孔板也夠了
CRISPR-Cas9基因編輯6--挑單克隆技術哪家強前言: 挑選到滿意的sgRNA之后,就要開始正式實驗馍盟,而正式實驗中細胞轉染部分我則不會再講于置,直接到最關鍵的部分:挑取單克隆茧吊。 實驗正文 1. 實驗準備 常規(guī)試劑贞岭、儀器:轉染試...
@b2e3219b1c5d 如果不長的話,直接找公司合成吧搓侄,同源重組也有錯配的瞄桨,好大一番動靜下來,還不一定能做出來呢讶踪。如果你的定點附近有一些酶切位點芯侥,我覺得可以用Gibson assembly的方法來完成。你在snap gene里面可以直接設計的乳讥。至于你老師說的那種有很長同源臂的同源重組柱查,這個同源臂你也得合成,然后加入到外源基因2的質粒上云石,你還要構建非常久的質粒唉工。時間上劃不來,還是覺得你直接合成這段融合基因序列汹忠,也不會太費錢淋硝。
CRISPR-Cas9基因編輯4--確定Cas9質粒構建成功+漂亮的質粒轉染簡介和前期文章 我對之前的所有教程進行了再次詳細的總結CRISPR-Cas9基因編輯之背景介紹及gRNA設計(上)[http://www.reibang.com/p/e5c...
@多多 可以多培養(yǎng)幾天喲
CRISPR-Cas9基因編輯6--挑單克隆技術哪家強前言: 挑選到滿意的sgRNA之后,就要開始正式實驗宽菜,而正式實驗中細胞轉染部分我則不會再講谣膳,直接到最關鍵的部分:挑取單克隆。 實驗正文 1. 實驗準備 常規(guī)試劑铅乡、儀器:轉染試...